Nếu như trước đây, việc xét nghiệm tại Trung tâm Y tế dự phòng chủ yếu là lấy mẫu bệnh phẩm về bệnh dịch và gửi đi tuyến trên. Thì nay, khoa xét nghiệm của trung tâm đã được trang bị hệ thống máy hiện đại phục vụ xét nghiệm về chẩn đoán nguyên nhân của bệnh dịch, chẩn đoán bệnh không lây nhiễm, bệnh nội tiết, phát hiện sớm ung thư, hệ thống máy sinh hóa, huyết học tự động, máy quang phổ hấp thụ nguyên tử AAS...

Bên cạnh đó, Trung tâm còn có labo xét nghiệm hóa lý đạt chuẩn ISO 17025 thực hiện tốt các xét nghiệm phục vụ sinh hoạt và sản xuất, kể cả xét nghiệm các mẫu về thực phẩm, xác định dư lượng thuốc bảo vệ thực vật, kim loại nặng,...

Trung tâm Y tế dự phòng đã trở thành đơn vị đi đầu của tỉnh trong phát triển labo xét nghiệm, coi đó là mũi nhọn phát triển kỹ thuật y tế dự phòng.